Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc189Q6NZQ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc189Q6NZQ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc189Q6NZQ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc189Q6NZQ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms