Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Szrd1Q6NXN1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Szrd1Q6NXN1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Szrd1Q6NXN1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms