Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggnbp1Q6K1E7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggnbp1Q6K1E7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms