Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ddx11Q6AXC6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ddx11Q6AXC6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddx11Q6AXC6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx11Q6AXC6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms