Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Kiaa1549Q68FD9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Kiaa1549Q68FD9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Kiaa1549Q68FD9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
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Kiaa1549Q68FD9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Kiaa1549Q68FD9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Kiaa1549Q68FD9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Kiaa1549Q68FD9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kiaa1549Q68FD9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Kiaa1549Q68FD9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kiaa1549Q68FD9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kiaa1549Q68FD9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kiaa1549Q68FD9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kiaa1549Q68FD9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kiaa1549Q68FD9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Kiaa1549Q68FD9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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