Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim24Q64127 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim24Q64127 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim24Q64127 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms