Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pan3Q640Q5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pan3Q640Q5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pan3Q640Q5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms