Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tfe3Q64092 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tfe3Q64092 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tfe3Q64092 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfe3Q64092 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms