Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phc1Q64028 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phc1Q64028 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phc1Q64028 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phc1Q64028 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phc1Q64028 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phc1Q64028 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Phc1Q64028 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phc1Q64028 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phc1Q64028 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phc1Q64028 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phc1Q64028 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phc1Q64028 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phc1Q64028 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phc1Q64028 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phc1Q64028 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms