Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa13Q62424 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hoxa13Q62424 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms