Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3a2Q62203 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3a2Q62203 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3a2Q62203 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms