Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttf1Q62187 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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Ttf1Q62187 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Ttf1Q62187 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttf1Q62187 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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