Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rbm38Q62176 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbm38Q62176 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbm38Q62176 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbm38Q62176 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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