Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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PtprrQ62132 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PtprrQ62132 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprrQ62132 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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PtprrQ62132 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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PtprrQ62132 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PtprrQ62132 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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PtprrQ62132 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprrQ62132 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprrQ62132 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprrQ62132 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms