Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smarcd1Q61466 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarcd1Q61466 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms