Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mre11Q61216 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Mre11Q61216 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mre11Q61216 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms