Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Irf9Q61179 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Irf9Q61179 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Irf9Q61179 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Irf9Q61179 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irf9Q61179 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irf9Q61179 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irf9Q61179 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Irf9Q61179 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Irf9Q61179 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Irf9Q61179 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Irf9Q61179 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irf9Q61179 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irf9Q61179 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Irf9Q61179 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irf9Q61179 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irf9Q61179 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irf9Q61179 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irf9Q61179 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irf9Q61179 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irf9Q61179 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Irf9Q61179 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irf9Q61179 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irf9Q61179 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irf9Q61179 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irf9Q61179 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Irf9Q61179 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irf9Q61179 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irf9Q61179 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Irf9Q61179 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Irf9Q61179 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Irf9Q61179 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Irf9Q61179 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Irf9Q61179 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Irf9Q61179 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irf9Q61179 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2616.2 ms