Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf4Q60793 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Klf4Q60793 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Klf4Q60793 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms