Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctf1Q60753 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctf1Q60753 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctf1Q60753 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctf1Q60753 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctf1Q60753 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctf1Q60753 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctf1Q60753 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctf1Q60753 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctf1Q60753 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctf1Q60753 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms