Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema5bQ60519 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema5bQ60519 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema5bQ60519 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema5bQ60519 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema5bQ60519 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema5bQ60519 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema5bQ60519 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema5bQ60519 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema5bQ60519 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sema5bQ60519 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema5bQ60519 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 793.7 ms