Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scarf1Q5ND28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scarf1Q5ND28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scarf1Q5ND28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms