Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCI0

Urgcp, Up-regulator of cell proliferation, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrgcpQ5NCI0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UrgcpQ5NCI0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UrgcpQ5NCI0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UrgcpQ5NCI0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UrgcpQ5NCI0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UrgcpQ5NCI0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UrgcpQ5NCI0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UrgcpQ5NCI0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UrgcpQ5NCI0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UrgcpQ5NCI0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UrgcpQ5NCI0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UrgcpQ5NCI0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UrgcpQ5NCI0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms