Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Prpf38aQ4FK66 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Prpf38aQ4FK66 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prpf38aQ4FK66 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf38aQ4FK66 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf38aQ4FK66 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf38aQ4FK66 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf38aQ4FK66 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf38aQ4FK66 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prpf38aQ4FK66 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms