Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srbd1Q497V5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srbd1Q497V5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srbd1Q497V5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srbd1Q497V5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms