Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Samt2Q497M0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samt2Q497M0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Samt2Q497M0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms