Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Carmil2Q3V3V9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Carmil2Q3V3V9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Carmil2Q3V3V9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms