Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc110Q3V125 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc110Q3V125 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc110Q3V125 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc110Q3V125 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms