Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm906Q3V0M1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm906Q3V0M1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm906Q3V0M1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm906Q3V0M1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm906Q3V0M1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm906Q3V0M1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm906Q3V0M1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm906Q3V0M1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm906Q3V0M1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm906Q3V0M1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm906Q3V0M1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm906Q3V0M1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm906Q3V0M1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm906Q3V0M1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms