Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930596D02RikQ3V0H9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.4 ms