Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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D130052B06RikQ3UW13 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D130052B06RikQ3UW13 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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D130052B06RikQ3UW13 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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D130052B06RikQ3UW13 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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D130052B06RikQ3UW13 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
D130052B06RikQ3UW13 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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