Protein–RNA interactions for Protein: Q3US96

Gm10735, Predicted gene 10735, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10735Q3US96 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm10735Q3US96 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10735Q3US96 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm10735Q3US96 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms