Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Vwa5b2Q3UR50 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Vwa5b2Q3UR50 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vwa5b2Q3UR50 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms