Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brd9Q3UQU0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brd9Q3UQU0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd9Q3UQU0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd9Q3UQU0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms