Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rufy4Q3TYX8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rufy4Q3TYX8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rufy4Q3TYX8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rufy4Q3TYX8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms