Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Srsf6Q3TWW8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Srsf6Q3TWW8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Srsf6Q3TWW8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Srsf6Q3TWW8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms