Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Shcbp1lQ3TTP0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shcbp1lQ3TTP0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shcbp1lQ3TTP0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Shcbp1lQ3TTP0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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