Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTL0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTL0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q3TTL0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTL0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTL0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTL0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3TTL0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTL0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TTL0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TTL0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3TTL0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTL0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3TTL0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms