Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XylbQ3TNA1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XylbQ3TNA1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XylbQ3TNA1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
XylbQ3TNA1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
XylbQ3TNA1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
XylbQ3TNA1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
XylbQ3TNA1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
XylbQ3TNA1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
XylbQ3TNA1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
XylbQ3TNA1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
XylbQ3TNA1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
XylbQ3TNA1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
XylbQ3TNA1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XylbQ3TNA1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XylbQ3TNA1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
XylbQ3TNA1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
XylbQ3TNA1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms