Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf2f1Q3THK3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf2f1Q3THK3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2f1Q3THK3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2f1Q3THK3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms