Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam171bQ14CH0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam171bQ14CH0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam171bQ14CH0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam171bQ14CH0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam171bQ14CH0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam171bQ14CH0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms