Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc138Q0VF22 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc138Q0VF22 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc138Q0VF22 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc138Q0VF22 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms