Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Caprin2Q05A80 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Caprin2Q05A80 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Caprin2Q05A80 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Caprin2Q05A80 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms