Protein–RNA interactions for Protein: Q059Y8

Dcst1, E3 ubiquitin-protein ligase DCST1, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcst1Q059Y8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dcst1Q059Y8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dcst1Q059Y8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dcst1Q059Y8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms