Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pfdn6Q03958 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pfdn6Q03958 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pfdn6Q03958 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms