Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmklr1P97468 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cmklr1P97468 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cmklr1P97468 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms