Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gabpb2P81069 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gabpb2P81069 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabpb2P81069 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabpb2P81069 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms