Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CiitaP79621 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CiitaP79621 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CiitaP79621 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CiitaP79621 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CiitaP79621 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CiitaP79621 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CiitaP79621 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CiitaP79621 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CiitaP79621 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CiitaP79621 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CiitaP79621 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CiitaP79621 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CiitaP79621 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CiitaP79621 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CiitaP79621 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CiitaP79621 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CiitaP79621 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms