Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntn5P68500 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntn5P68500 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cntn5P68500 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms