Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tubb4bP68372 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tubb4bP68372 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tubb4bP68372 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tubb4bP68372 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms