Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk2bP67871 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk2bP67871 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Csnk2bP67871 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Csnk2bP67871 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2bP67871 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2bP67871 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2bP67871 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Csnk2bP67871 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms